清家　泰介 (Taisuke Seike)

　
　　　 　　　
  • 大阪大学 大学院情報科学研究科 バイオ情報計測学講座 助教 (2020.9 -)
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研究の興味

  • 酵母の有性生殖の進化
  • 野生酵母の生態

学歴

  • 2005.4 - 2009.3　大阪市立大学 理学部 生物学科
  • 2009.4 - 2011.3　大阪市立大学 大学院理学研究科 生物地球系専攻 前期博士課程
  • 2011.4 - 2014.3　大阪市立大学 大学院理学研究科 生物地球系専攻 後期博士課程
  • 2014.3　博士 (理学)取得

経歴

  • 2009.4 - 2011.3　大阪府立住吉高等学校 非常勤講師 (SSH)
  • 2011.4 - 2014.3　大阪市立大学 大学院理学研究科 日本学術振興会特別研究員DC1
  • 2014.4 - 2015.3　産業技術総合研究所 生物プロセス研究部門 博士研究員
  • 2015.4 - 2018.3　国立遺伝学研究所 遺伝形質研究系 日本学術振興会特別研究員PD
  • 2018.4 - 2020.8　理化学研究所 生命機能科学研究センター 基礎科学特別研究員
  • 2020.9 - 現在　大阪大学 大学院情報科学研究科 バイオ情報計測学講座 助教
  • 2020.9 - 現在　理化学研究所 生命機能科学研究センター 客員研究員
  • 2021.4 - 現在　大阪大学 先導的学際研究機構 産業バイオイニシアティブ研究部門 兼任教員
  • 2021.10 - 現在　国立研究開発法人科学技術振興機構 (JST) ACT-X研究者

資格

  • 2011.6　日本学生支援機構大学院第一種奨学生「特に優れた業績による返金免除」
  • 2014.2.15　高等学校教諭専修免許状 (理科) (平25高専第67号)
  • 2014.3.24　博士 (理学) (学位記番号: 第5998号)
  • 2022.8.1　甲種危険物取扱者免状 (交付番号: 00566)

受賞

  • 2011.3.26　日本農芸化学会 2011年度トピックス賞
  • 2017.2.3　井上科学振興財団 第33回井上研究奨励賞
  • 2018.3.6　第12回日本ゲノム微生物学会年会 若手賞
  • 2018.11.2　酵母細胞研究会 平成29年度地神芳文記念研究助成賞
  • 2019.3.8　第13回日本ゲノム微生物学会年会 優秀ポスター賞
  • 2019.5.30　理化学研究所 松本理事長感謝状
  • 2022.9.9　酵母遺伝学フォーラム第55回研究報告会 会長賞

論文・総説

  1. *Seike T, Takekata H, Uchida Y, Sakata N, Furusawa C, Matsuda F (2022) Wickerhamiella bidentis sp. nov., a novel yeast species isolated from flowers and insects in Japan. Int J Syst Evol Microbiol, in press (査読有)
  2. *Seike T, Niki H (2022) Pheromone response and mating behavior in fission yeast. Microbiol Mol Biol Rev, 86(4): e0013022 (査読有, 依頼有) [Link]
  3. Otsuka K, Seike T, Toya Y, Ishii J, Hirono-Hara Y, Hara KY, *Matsuda F (2022) Evolutionary approach for improved proton pumping activity of heterologous rhodopsin expressed in Escherichia coli. J Biosci Bioeng, 134(6): 484-490 (査読有) [Link]
  4. Morita K, Seike T, Ishii J, Matsuda F, *Shimizu H (2022) Improvement of 2, 3-butanediol production by dCas9 gene expression system in Saccharomyces cerevisiae., J Biosci Bioeng, 133(3): 208-212 (査読有) [Link]
  5. *Seike T, Sakata N, Shimoda C, Niki H, Furusawa C (2021) The sixth transmembrane region of a pheromone G-protein coupled receptor, Map3, is implicated in discrimination of closely related pheromones in Schizosaccharomyces pombe., Genetics, 219(4): iyab150 (査読有) [Link]
  6. Yatabe F, Okahashi N, Seike T, *Matsuda F (2021) Comparative 13C-metabolic flux analysis indicates elevation of ATP regeneration, carbon dioxide, and heat production in industrial Saccharomyces cerevisiae strains., Biotechnol J, 13: e2000438 (査読有) [Link]
  7. *Seike T, Sakata N, Matsuda F, Furusawa C (2021) Elevated sporulation efficiency in fission yeast Schizosaccharomyces japonicus strains isolated from Drosophila., J Fungi, 7(5): 350 (査読有) [Link]
  8. Seike T, Narazaki Y, Kaneko Y, Shimizu H, *Matsuda F (2021) Random transfer of Ogataea polymorpha genes into Saccharomyces cerevisiae reveals a complex background of heat tolerance., J Fungi, 7(4): 302 (査読有) [Link]
  9. *Seike T, Maekawa H, Nakamura T, Shimoda C (2019) The asymmetric chemical structures of two mating pheromones reflect their differential roles in mating of fission yeast., J Cell Sci, 132(12): jcs230722 (査読有) [Link]
  10. Seike T, Kobayashi Y, Sahara T, Ohgiya S, Kamagata Y, *Fujimori KE (2019) Molecular evolutionary engineering to improve catalytic activity and performance of Saccharomyces cerevisiae xylose isomerase for micro-aerobic glucose/xylose co-fermentation., Biotechnol Biofuels, 12:139 (査読有) [Link]
  11. *Fujimori KE, Kobayashi Y, Seike T, Sahara T, Ohgiya S, Kamagata Y (2019) Whole genome sequence of an isogenic haploid strain Saccharomyces cerevisiae IR-2idA30(MATa) established from the industrial diploid strain IR-2., Microbiol Resour Announc, 8(17):e00018-19 (査読有) [Link]
  12. *Seike T (2019) The evolution of peptide mating pheromones in fission yeast., Curr Genet, 65(5): 1107-1111 (査読有, 依頼有) [Link]
  13. *Seike T, Shimoda C (2019) Role of pheromone recognition systems in creating new species of fission yeast., Microb Cell, 6(4): 209-211 (依頼有) [Link]
  14. *Seike T, Shimoda C, Niki H (2019) Asymmetric diversification of mating pheromones in fission yeast., PLoS Biol, 17(1): e3000101 (査読有) [Link]
  15. *清家泰介, 下田親 (2018) 種分化を導くフェロモンと受容体の協調的な進化 - 分裂酵母の新しい生殖群の創出, 化学と生物, 56(1):7-9 (査読有, 依頼有) [Link]
  16. Seike T, *Niki H (2017) Mating response and construction of heterothallic strains of the fission yeast Schizosaccharomyces octosporus., FEMS Yeast Res, 17(5): fox045 (査読有) [Link]
  17. Seike T, Nakamura T, *Shimoda C (2015) Molecular coevolution of a sex pheromone and its receptor triggers reproductive isolation in Schizosaccharomyces pombe., PNAS, 112(14): 4405-4410 (査読有) [Link]
  18. *Seike T, Nakamura T, Shimoda C (2013) Distal and proximal actions of peptide pheromone M-factor control different conjugation steps in fission yeast., PLoS ONE, 8(7): e69491 (査読有) [Link]
  19. Seike T, Yamagishi Y, Iio H, Nakamura T, *Shimoda C (2012) Remarkably simple sequence requirement of the M-factor pheromone of Schizosaccharomyces pombe., Genetics, 191(3): 815-825 (査読有) [Link]

特許

  • 清家泰介 (40%), 藤森一浩 (20%), 小林洋介 (10%), 佐原健彦 (20%), 扇谷悟 (5%), 鎌形洋一 (5%), 発明の名称: 変異型キシロース代謝酵素とその利用, 出願番号: 特願2016-62838, 2016年3月25日 (出願), 国際公開番号: WO/2017/164388 (公開)